组学

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组学

我们的细胞外囊泡（EV）组学服务结合了转录组学和蛋白质组学，以分析EV并获得有关其组成、功能以及作为诊断、预后和预测标志物的宝贵见解。

转录组分析

使用下一代高通量测序，Jotbody对EVs进行转录组测序，通过逆转录将mRNA转化为cDNA。全程提供特定样本在特定时间点的全面mRNA序列信息。Jotbody还提供全转录组分析，研究特定组织或细胞的完整转录组信息。我们的分析包括编码RNA（mRNA）和非编码RNA（如miRNA、lncRNA和circRNA），使用第二代测序平台和文库构建方法。

标准化的数据分析 描述
质量控制 数据质量保证
参考基因组对比 与参考基因组比对
新基因预测 新基因预测
差异表达分析 基因表达差异检查
功能注释与富集 基因功能的注释与富集
蛋白质相互作用网络分析 蛋白质相互作用的分析

蛋白质组分析

我们的蛋白质组学服务利用先进的质谱技术对EV蛋白质组进行全面分析。我们采用数据无关采集（DIA）方法，确保EV蛋白质组的全面覆盖和准确定量。

周期 DIA 技术 交付
3周
  • Direct-DIA
  • GPF-DIA
  • 基于分级DDA的DIA
  • 质谱分析
  • 最终报告

最终报告包括但不限于以下分析类别：

  • 全局分析
    • 全局聚类热图
    • Pearson相关性分析
    • 主成分分析（PCA）
    • 偏最小二乘判别分析（PLS-DA）
    • 变异系数的小提琴图
  • 差异蛋白选择
    • 蛋白质统计
    • 火山图
    • 热图比较
    • 个别差异蛋白比较
  • 功能分析
    • 基因本体（GO）
    • KEGG
    • Reactome
    • 蛋白质-蛋白质相互作用

利用我们先进的方法，可实现定量精度提高9倍，相当于金标准的SRM/MRM靶向技术，样品识别重复性提高近50%，能够准确识别EVs内的蛋白质和磷酸化蛋白。

代表性数据

Jotbody的EV蛋白质组学服务的关键可视化数据：全局聚类热图显示总体表达模式，样本相关矩阵 测量两个变量之间的相关性，火山图反映总体蛋白质差异，小提琴图显示表达变异，GO富集图揭示富集 术语，KEGG通路图显示注释的通路。