Ómica

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Ómica

Nuestro servicio de Ómica de vesículas extracelulares (EV) combina la transcriptómica y la proteómica para analizar los EVs y obtener valiosos conocimientos sobre su composición, funciones y potencial como marcadores diagnósticos, pronósticos y predictivos.

Transcriptómica

Utilizando secuenciación de alto rendimiento de próxima generación, realizamos secuenciación del transcriptoma en EVs, convirtiendo ARNm en cDNA a través de la transcripción inversa. Este proceso proporciona información completa de secuencias de ARNm de muestras específicas en momentos específicos.

También ofrecemos análisis completo del transcriptoma, estudiando el conjunto completo de información del transcriptoma en una organización o célula específica. Nuestro análisis incluye ARN codificante (ARNm) y ARN no codificante (como miARN, lncARN y circARN), utilizando plataformas de secuenciación de segunda generación y métodos de construcción de librerías.

Análisis de datos estándar Descripción
Control de calidad Aseguramiento de la calidad de los datos
Alineación al genoma de referencia Alineación al genoma de referencia
Predicción de nuevos genes Predicción de genes novedosos
Análisis de expresión diferencial Examen de las variaciones en la expresión génica
Anotación funcional y enriquecimiento Anotación y enriquecimiento de funciones génicas
Análisis de redes de interacción proteica Análisis de interacciones proteicas

Proteómica

Nuestro servicio de proteómica utiliza técnicas de vanguardia de espectrometría de masas para llevar a cabo un análisis exhaustivo del proteoma de los EV. Para lograr esto, empleamos métodos de adquisición de datos independientes (DIA), que garantizan una cobertura exhaustiva y una cuantificación precisa del proteoma de los EV.

Tiempo de entrega Técnicas DIA Deliverables
3 semanas
  • Direct-DIA
  • GPF-DIA
  • DIA basado en DDA fraccionado
  • Análisis de espectrometría de masas
  • Informe final detallado

Nuestro informe final detallado incluye, pero no se limita a, las siguientes categorías de análisis:

  • Análisis Global
    • Mapa de calor de clúster global
    • Análisis de correlación de Pearson
    • Análisis de componentes principales (PCA)
    • Análisis PLS-DA (Análisis Discriminante de Mínimos Cuadrados Parciales)
    • Gráfico de violín de coeficiente de variación
  • Selección de Proteínas Diferenciales
    • Estadísticas de proteínas
    • Gráfico de volcán
    • Comparación de mapas de calor
    • Comparación de Proteínas Individuales Diferenciales
  • Análisis Funcional
    • Ontología génica (GO)
    • KEGG
    • Reactome
    • Interacciones proteína-proteína

El aprovechamiento de nuestras metodologías avanzadas produce un aumento de 9 veces en la precisión cuantitativa, similar a la tecnología de destino estándar de oro SRM/MRM, con casi un 50% de mejora en la repetibilidad de identificación de muestras para una identificación precisa de proteínas y fosfoproteínas dentro de los EVs.

Datos representativos

Principales visualizaciones de nuestro servicio proteómico de EV: un mapa de calor de clúster global que muestra patrones de expresión globales, una matriz de correlación de muestras que mide las correlaciones entre dos variables, un gráfico de volcán que refleja las diferencias generales de proteínas, un gráfico de violín de proteínas diferenciales que ilustra las variaciones de expresión, un gráfico de enriquecimiento GO que revela términos enriquecidos y mapas de vías KEGG que representan las vías anotadas.